Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFX1Q12986 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFX1Q12986 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFX1Q12986 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFX1Q12986 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NFX1Q12986 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFX1Q12986 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NFX1Q12986 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFX1Q12986 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NFX1Q12986 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NFX1Q12986 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NFX1Q12986 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFX1Q12986 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFX1Q12986 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFX1Q12986 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NFX1Q12986 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NFX1Q12986 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NFX1Q12986 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NFX1Q12986 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFX1Q12986 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NFX1Q12986 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NFX1Q12986 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFX1Q12986 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFX1Q12986 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
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