Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP4Q09028 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP4Q09028 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP4Q09028 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms