Protein–RNA interactions for Protein: Q08881

ITK, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITKQ08881 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITKQ08881 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITKQ08881 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITKQ08881 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITKQ08881 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITKQ08881 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITKQ08881 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITKQ08881 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITKQ08881 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITKQ08881 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITKQ08881 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITKQ08881 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITKQ08881 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITKQ08881 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITKQ08881 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITKQ08881 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITKQ08881 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITKQ08881 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITKQ08881 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITKQ08881 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITKQ08881 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITKQ08881 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITKQ08881 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITKQ08881 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITKQ08881 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITKQ08881 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITKQ08881 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITKQ08881 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITKQ08881 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ITKQ08881 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITKQ08881 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITKQ08881 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITKQ08881 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITKQ08881 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITKQ08881 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITKQ08881 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITKQ08881 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITKQ08881 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITKQ08881 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITKQ08881 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITKQ08881 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITKQ08881 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITKQ08881 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITKQ08881 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITKQ08881 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITKQ08881 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITKQ08881 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITKQ08881 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITKQ08881 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITKQ08881 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITKQ08881 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITKQ08881 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITKQ08881 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITKQ08881 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITKQ08881 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITKQ08881 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITKQ08881 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITKQ08881 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITKQ08881 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITKQ08881 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITKQ08881 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITKQ08881 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITKQ08881 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITKQ08881 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITKQ08881 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITKQ08881 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITKQ08881 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITKQ08881 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITKQ08881 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITKQ08881 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITKQ08881 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITKQ08881 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITKQ08881 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITKQ08881 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITKQ08881 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITKQ08881 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITKQ08881 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITKQ08881 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITKQ08881 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITKQ08881 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITKQ08881 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITKQ08881 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITKQ08881 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITKQ08881 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITKQ08881 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITKQ08881 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITKQ08881 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITKQ08881 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITKQ08881 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITKQ08881 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITKQ08881 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITKQ08881 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITKQ08881 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITKQ08881 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITKQ08881 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITKQ08881 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITKQ08881 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITKQ08881 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITKQ08881 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITKQ08881 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms