Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX8Q06710 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX8Q06710 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX8Q06710 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms