Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAX8Q06710 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAX8Q06710 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAX8Q06710 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAX8Q06710 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAX8Q06710 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX8Q06710 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PAX8Q06710 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAX8Q06710 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAX8Q06710 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAX8Q06710 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAX8Q06710 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAX8Q06710 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAX8Q06710 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAX8Q06710 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAX8Q06710 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAX8Q06710 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAX8Q06710 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAX8Q06710 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAX8Q06710 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAX8Q06710 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAX8Q06710 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAX8Q06710 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAX8Q06710 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAX8Q06710 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAX8Q06710 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAX8Q06710 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX8Q06710 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX8Q06710 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAX8Q06710 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAX8Q06710 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAX8Q06710 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAX8Q06710 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX8Q06710 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX8Q06710 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX8Q06710 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAX8Q06710 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAX8Q06710 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PAX8Q06710 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAX8Q06710 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAX8Q06710 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAX8Q06710 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAX8Q06710 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX8Q06710 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX8Q06710 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAX8Q06710 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PAX8Q06710 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAX8Q06710 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAX8Q06710 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAX8Q06710 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAX8Q06710 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAX8Q06710 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAX8Q06710 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAX8Q06710 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAX8Q06710 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAX8Q06710 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX8Q06710 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX8Q06710 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX8Q06710 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAX8Q06710 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX8Q06710 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAX8Q06710 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAX8Q06710 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PAX8Q06710 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAX8Q06710 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX8Q06710 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAX8Q06710 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAX8Q06710 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAX8Q06710 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX8Q06710 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAX8Q06710 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX8Q06710 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAX8Q06710 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAX8Q06710 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAX8Q06710 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX8Q06710 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX8Q06710 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX8Q06710 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX8Q06710 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX8Q06710 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX8Q06710 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX8Q06710 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX8Q06710 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX8Q06710 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX8Q06710 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX8Q06710 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX8Q06710 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX8Q06710 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX8Q06710 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX8Q06710 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAX8Q06710 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX8Q06710 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX8Q06710 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX8Q06710 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX8Q06710 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX8Q06710 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAX8Q06710 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAX8Q06710 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAX8Q06710 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX8Q06710 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms