Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERVK_113P63132 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERVK_113P63132 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HERVK_113P63132 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113P63132 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms