Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRA2BP62995 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRA2BP62995 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms