Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2FP61218 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2FP61218 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2FP61218 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2FP61218 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2FP61218 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2FP61218 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2FP61218 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2FP61218 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2FP61218 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR2FP61218 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms