Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCCD1P59942 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCCD1P59942 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCCD1P59942 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms