Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00315P59091 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00315P59091 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00315P59091 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00315P59091 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00315P59091 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00315P59091 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00315P59091 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00315P59091 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00315P59091 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00315P59091 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00315P59091 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00315P59091 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00315P59091 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00315P59091 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms