Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RHBDL3P58872 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RHBDL3P58872 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RHBDL3P58872 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RHBDL3P58872 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RHBDL3P58872 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RHBDL3P58872 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RHBDL3P58872 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RHBDL3P58872 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RHBDL3P58872 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RHBDL3P58872 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RHBDL3P58872 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms