Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RWDD2BP57060 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RWDD2BP57060 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RWDD2BP57060 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RWDD2BP57060 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RWDD2BP57060 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RWDD2BP57060 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RWDD2BP57060 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RWDD2BP57060 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RWDD2BP57060 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD2BP57060 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms