Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN15P56746 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN15P56746 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN15P56746 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN15P56746 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms