Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
OXCT1P55809 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
OXCT1P55809 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OXCT1P55809 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OXCT1P55809 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OXCT1P55809 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms