Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
BRPF1P55201 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
BRPF1P55201 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
BRPF1P55201 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms