Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H2P55055 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H2P55055 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NR1H2P55055 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H2P55055 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms