Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCAN1P53805 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RCAN1P53805 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCAN1P53805 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms