Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAP1GDS1P52306 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAP1GDS1P52306 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAP1GDS1P52306 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms