Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPC3P51654 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPC3P51654 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GPC3P51654 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPC3P51654 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPC3P51654 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GPC3P51654 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPC3P51654 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPC3P51654 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPC3P51654 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPC3P51654 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPC3P51654 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPC3P51654 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPC3P51654 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPC3P51654 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPC3P51654 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPC3P51654 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPC3P51654 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC3P51654 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC3P51654 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC3P51654 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPC3P51654 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPC3P51654 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPC3P51654 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC3P51654 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC3P51654 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC3P51654 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC3P51654 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC3P51654 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC3P51654 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC3P51654 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GPC3P51654 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPC3P51654 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPC3P51654 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPC3P51654 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPC3P51654 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GPC3P51654 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPC3P51654 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPC3P51654 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPC3P51654 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC3P51654 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC3P51654 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC3P51654 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC3P51654 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPC3P51654 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPC3P51654 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPC3P51654 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC3P51654 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC3P51654 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC3P51654 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC3P51654 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC3P51654 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC3P51654 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC3P51654 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC3P51654 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC3P51654 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC3P51654 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC3P51654 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC3P51654 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC3P51654 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
GPC3P51654 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPC3P51654 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GPC3P51654 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GPC3P51654 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GPC3P51654 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GPC3P51654 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPC3P51654 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GPC3P51654 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GPC3P51654 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GPC3P51654 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GPC3P51654 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPC3P51654 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GPC3P51654 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GPC3P51654 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPC3P51654 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GPC3P51654 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPC3P51654 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GPC3P51654 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPC3P51654 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GPC3P51654 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPC3P51654 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GPC3P51654 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GPC3P51654 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GPC3P51654 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GPC3P51654 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GPC3P51654 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC3P51654 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC3P51654 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC3P51654 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC3P51654 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC3P51654 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC3P51654 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC3P51654 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC3P51654 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC3P51654 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC3P51654 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC3P51654 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC3P51654 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC3P51654 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC3P51654 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms