Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSEN2P49810 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSEN2P49810 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSEN2P49810 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSEN2P49810 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PSEN2P49810 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms