Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3P48764 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A3P48764 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A3P48764 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms