Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSSP48449 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSSP48449 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LSSP48449 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LSSP48449 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSSP48449 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSSP48449 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSSP48449 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSSP48449 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSSP48449 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LSSP48449 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSSP48449 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSSP48449 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSSP48449 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSSP48449 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSSP48449 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSSP48449 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSSP48449 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSSP48449 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSSP48449 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSSP48449 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSSP48449 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSSP48449 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSSP48449 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LSSP48449 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LSSP48449 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSSP48449 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSSP48449 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSSP48449 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSSP48449 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSSP48449 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSSP48449 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSSP48449 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSSP48449 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSSP48449 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSSP48449 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSSP48449 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSSP48449 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSSP48449 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSSP48449 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSSP48449 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSSP48449 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSSP48449 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LSSP48449 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSSP48449 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSSP48449 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSSP48449 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSSP48449 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSSP48449 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSSP48449 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSSP48449 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSSP48449 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSSP48449 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSSP48449 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSSP48449 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSSP48449 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSSP48449 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSSP48449 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSSP48449 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSSP48449 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSSP48449 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSSP48449 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSSP48449 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LSSP48449 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSSP48449 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSSP48449 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSSP48449 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSSP48449 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSSP48449 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSSP48449 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSSP48449 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSSP48449 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSSP48449 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSSP48449 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSSP48449 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSSP48449 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSSP48449 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSSP48449 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSSP48449 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSSP48449 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSSP48449 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSSP48449 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSSP48449 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSSP48449 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSSP48449 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSSP48449 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSSP48449 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSSP48449 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSSP48449 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSSP48449 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSSP48449 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSSP48449 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSSP48449 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSSP48449 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSSP48449 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSSP48449 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSSP48449 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSSP48449 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSSP48449 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSSP48449 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms