Protein–RNA interactions for Protein: P48029

SLC6A8, Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8P48029 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A8P48029 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC6A8P48029 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A8P48029 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms