Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTSOP43234 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTSOP43234 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTSOP43234 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTSOP43234 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSOP43234 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSOP43234 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSOP43234 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSOP43234 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSOP43234 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSOP43234 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSOP43234 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSOP43234 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSOP43234 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSOP43234 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTSOP43234 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSOP43234 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSOP43234 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSOP43234 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSOP43234 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSOP43234 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSOP43234 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSOP43234 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSOP43234 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSOP43234 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSOP43234 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSOP43234 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSOP43234 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSOP43234 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSOP43234 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSOP43234 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSOP43234 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSOP43234 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSOP43234 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSOP43234 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSOP43234 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSOP43234 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSOP43234 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTSOP43234 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTSOP43234 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTSOP43234 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSOP43234 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSOP43234 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSOP43234 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSOP43234 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSOP43234 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSOP43234 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSOP43234 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSOP43234 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSOP43234 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSOP43234 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSOP43234 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTSOP43234 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTSOP43234 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTSOP43234 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTSOP43234 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTSOP43234 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTSOP43234 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTSOP43234 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CTSOP43234 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTSOP43234 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTSOP43234 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSOP43234 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTSOP43234 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTSOP43234 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTSOP43234 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTSOP43234 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSOP43234 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSOP43234 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSOP43234 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSOP43234 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSOP43234 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSOP43234 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSOP43234 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSOP43234 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSOP43234 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTSOP43234 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTSOP43234 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTSOP43234 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSOP43234 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSOP43234 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSOP43234 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSOP43234 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSOP43234 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSOP43234 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSOP43234 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSOP43234 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSOP43234 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSOP43234 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSOP43234 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTSOP43234 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSOP43234 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSOP43234 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSOP43234 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSOP43234 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSOP43234 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSOP43234 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSOP43234 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSOP43234 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSOP43234 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms