Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK1P39086 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK1P39086 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK1P39086 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK1P39086 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIK1P39086 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms