Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR2P33947 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDELR2P33947 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR2P33947 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR2P33947 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms