Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRAP19793 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRAP19793 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRAP19793 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRAP19793 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RXRAP19793 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RXRAP19793 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RXRAP19793 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RXRAP19793 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RXRAP19793 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RXRAP19793 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RXRAP19793 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RXRAP19793 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RXRAP19793 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RXRAP19793 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RXRAP19793 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RXRAP19793 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RXRAP19793 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RXRAP19793 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RXRAP19793 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RXRAP19793 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RXRAP19793 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RXRAP19793 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RXRAP19793 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RXRAP19793 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RXRAP19793 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RXRAP19793 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RXRAP19793 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RXRAP19793 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RXRAP19793 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RXRAP19793 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RXRAP19793 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RXRAP19793 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RXRAP19793 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RXRAP19793 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RXRAP19793 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RXRAP19793 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RXRAP19793 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RXRAP19793 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RXRAP19793 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RXRAP19793 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RXRAP19793 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RXRAP19793 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RXRAP19793 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RXRAP19793 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RXRAP19793 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RXRAP19793 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RXRAP19793 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RXRAP19793 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RXRAP19793 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RXRAP19793 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RXRAP19793 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RXRAP19793 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RXRAP19793 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RXRAP19793 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RXRAP19793 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RXRAP19793 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRAP19793 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RXRAP19793 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RXRAP19793 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RXRAP19793 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RXRAP19793 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RXRAP19793 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RXRAP19793 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RXRAP19793 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RXRAP19793 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RXRAP19793 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RXRAP19793 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RXRAP19793 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RXRAP19793 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RXRAP19793 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RXRAP19793 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RXRAP19793 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RXRAP19793 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RXRAP19793 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RXRAP19793 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RXRAP19793 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RXRAP19793 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RXRAP19793 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RXRAP19793 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RXRAP19793 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RXRAP19793 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RXRAP19793 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RXRAP19793 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RXRAP19793 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RXRAP19793 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RXRAP19793 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms