Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3P19429 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNI3P19429 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNI3P19429 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms