Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGR1P18146 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGR1P18146 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGR1P18146 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGR1P18146 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGR1P18146 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGR1P18146 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EGR1P18146 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EGR1P18146 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EGR1P18146 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
EGR1P18146 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EGR1P18146 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EGR1P18146 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EGR1P18146 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EGR1P18146 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EGR1P18146 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EGR1P18146 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR1P18146 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR1P18146 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR1P18146 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR1P18146 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EGR1P18146 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EGR1P18146 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EGR1P18146 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EGR1P18146 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR1P18146 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR1P18146 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR1P18146 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR1P18146 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR1P18146 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR1P18146 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EGR1P18146 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EGR1P18146 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EGR1P18146 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EGR1P18146 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EGR1P18146 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EGR1P18146 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EGR1P18146 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EGR1P18146 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EGR1P18146 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EGR1P18146 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR1P18146 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR1P18146 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR1P18146 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR1P18146 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR1P18146 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR1P18146 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR1P18146 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EGR1P18146 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EGR1P18146 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR1P18146 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR1P18146 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR1P18146 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR1P18146 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR1P18146 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR1P18146 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR1P18146 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EGR1P18146 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR1P18146 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR1P18146 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR1P18146 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR1P18146 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EGR1P18146 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR1P18146 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR1P18146 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR1P18146 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR1P18146 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EGR1P18146 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR1P18146 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR1P18146 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR1P18146 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR1P18146 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EGR1P18146 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EGR1P18146 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR1P18146 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EGR1P18146 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms