Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MUC1P15941 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MUC1P15941 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MUC1P15941 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MUC1P15941 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC1P15941 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC1P15941 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC1P15941 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC1P15941 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC1P15941 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC1P15941 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MUC1P15941 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MUC1P15941 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MUC1P15941 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MUC1P15941 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MUC1P15941 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MUC1P15941 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MUC1P15941 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MUC1P15941 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MUC1P15941 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MUC1P15941 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MUC1P15941 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MUC1P15941 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MUC1P15941 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MUC1P15941 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MUC1P15941 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MUC1P15941 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MUC1P15941 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MUC1P15941 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MUC1P15941 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MUC1P15941 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MUC1P15941 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MUC1P15941 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MUC1P15941 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MUC1P15941 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MUC1P15941 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MUC1P15941 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MUC1P15941 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MUC1P15941 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MUC1P15941 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MUC1P15941 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MUC1P15941 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MUC1P15941 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MUC1P15941 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MUC1P15941 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms