Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT10P13645 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT10P13645 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT10P13645 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT10P13645 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT10P13645 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT10P13645 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT10P13645 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT10P13645 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT10P13645 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT10P13645 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT10P13645 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT10P13645 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT10P13645 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT10P13645 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT10P13645 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT10P13645 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT10P13645 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT10P13645 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT10P13645 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT10P13645 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT10P13645 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT10P13645 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT10P13645 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT10P13645 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT10P13645 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT10P13645 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT10P13645 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT10P13645 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT10P13645 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT10P13645 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT10P13645 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT10P13645 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT10P13645 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT10P13645 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT10P13645 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT10P13645 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT10P13645 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT10P13645 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT10P13645 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT10P13645 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT10P13645 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT10P13645 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT10P13645 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT10P13645 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT10P13645 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT10P13645 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT10P13645 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT10P13645 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT10P13645 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT10P13645 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT10P13645 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT10P13645 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT10P13645 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT10P13645 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT10P13645 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT10P13645 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT10P13645 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT10P13645 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT10P13645 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT10P13645 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT10P13645 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT10P13645 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT10P13645 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT10P13645 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT10P13645 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT10P13645 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT10P13645 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT10P13645 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT10P13645 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT10P13645 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT10P13645 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT10P13645 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT10P13645 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT10P13645 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT10P13645 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT10P13645 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT10P13645 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT10P13645 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT10P13645 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT10P13645 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT10P13645 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT10P13645 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT10P13645 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT10P13645 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT10P13645 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT10P13645 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT10P13645 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT10P13645 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT10P13645 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT10P13645 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT10P13645 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT10P13645 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT10P13645 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT10P13645 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT10P13645 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT10P13645 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT10P13645 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT10P13645 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT10P13645 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms