Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXD8P13378 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXD8P13378 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HOXD8P13378 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD8P13378 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms