Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM225BP0DP42 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM225BP0DP42 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM225BP0DP42 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM225BP0DP42 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM225BP0DP42 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms