Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP3P08254 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP3P08254 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP3P08254 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP3P08254 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP3P08254 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP3P08254 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP3P08254 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP3P08254 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP3P08254 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP3P08254 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP3P08254 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP3P08254 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP3P08254 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP3P08254 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP3P08254 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP3P08254 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP3P08254 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP3P08254 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MMP3P08254 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MMP3P08254 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP3P08254 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MMP3P08254 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP3P08254 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP3P08254 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP3P08254 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP3P08254 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP3P08254 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP3P08254 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP3P08254 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP3P08254 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP3P08254 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP3P08254 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP3P08254 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP3P08254 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP3P08254 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP3P08254 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP3P08254 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP3P08254 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP3P08254 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP3P08254 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP3P08254 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP3P08254 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP3P08254 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP3P08254 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP3P08254 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MMP3P08254 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP3P08254 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP3P08254 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP3P08254 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP3P08254 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP3P08254 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP3P08254 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP3P08254 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP3P08254 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP3P08254 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP3P08254 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP3P08254 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP3P08254 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP3P08254 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP3P08254 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP3P08254 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP3P08254 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP3P08254 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP3P08254 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP3P08254 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP3P08254 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP3P08254 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP3P08254 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP3P08254 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP3P08254 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP3P08254 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP3P08254 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP3P08254 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP3P08254 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP3P08254 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP3P08254 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP3P08254 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP3P08254 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP3P08254 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP3P08254 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP3P08254 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP3P08254 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP3P08254 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP3P08254 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP3P08254 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP3P08254 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMP3P08254 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP3P08254 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP3P08254 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP3P08254 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP3P08254 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP3P08254 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP3P08254 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP3P08254 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MMP3P08254 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP3P08254 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP3P08254 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP3P08254 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP3P08254 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms