Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD1O95696 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD1O95696 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD1O95696 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD1O95696 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD1O95696 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD1O95696 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD1O95696 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD1O95696 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD1O95696 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD1O95696 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD1O95696 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD1O95696 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD1O95696 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD1O95696 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD1O95696 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD1O95696 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD1O95696 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD1O95696 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD1O95696 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD1O95696 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD1O95696 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD1O95696 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD1O95696 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRD1O95696 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD1O95696 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRD1O95696 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD1O95696 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD1O95696 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRD1O95696 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD1O95696 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD1O95696 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRD1O95696 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRD1O95696 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD1O95696 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD1O95696 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRD1O95696 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BRD1O95696 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRD1O95696 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRD1O95696 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRD1O95696 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRD1O95696 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRD1O95696 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRD1O95696 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BRD1O95696 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD1O95696 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD1O95696 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD1O95696 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD1O95696 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD1O95696 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD1O95696 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD1O95696 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD1O95696 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRD1O95696 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRD1O95696 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRD1O95696 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRD1O95696 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRD1O95696 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRD1O95696 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRD1O95696 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRD1O95696 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRD1O95696 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRD1O95696 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD1O95696 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD1O95696 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD1O95696 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD1O95696 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD1O95696 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD1O95696 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD1O95696 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD1O95696 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD1O95696 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD1O95696 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD1O95696 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD1O95696 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD1O95696 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD1O95696 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD1O95696 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD1O95696 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD1O95696 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD1O95696 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRD1O95696 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD1O95696 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD1O95696 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD1O95696 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD1O95696 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD1O95696 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD1O95696 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRD1O95696 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD1O95696 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD1O95696 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRD1O95696 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD1O95696 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD1O95696 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD1O95696 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD1O95696 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD1O95696 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD1O95696 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRD1O95696 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRD1O95696 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms