Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ZIC2O95409 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZIC2O95409 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIC2O95409 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms