Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYPD3O95274 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD3O95274 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD3O95274 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYPD3O95274 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYPD3O95274 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LYPD3O95274 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYPD3O95274 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYPD3O95274 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYPD3O95274 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYPD3O95274 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYPD3O95274 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms