Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FLOT1O75955 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FLOT1O75955 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms