Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB7O75200 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB7O75200 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB7O75200 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB7O75200 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPIPB7O75200 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPB7O75200 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB7O75200 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.5 ms