Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SS18L1O75177 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SS18L1O75177 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SS18L1O75177 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SS18L1O75177 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms