Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM4AO75164 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM4AO75164 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM4AO75164 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms