Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAPN9O14815 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN9O14815 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN9O14815 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN9O14815 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms