Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCRL2O00421 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCRL2O00421 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCRL2O00421 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms