Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCCD1A6NED2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCCD1A6NED2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RCCD1A6NED2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RCCD1A6NED2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RCCD1A6NED2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RCCD1A6NED2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCCD1A6NED2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms