Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS37CA5D8V6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS37CA5D8V6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS37CA5D8V6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
VPS37CA5D8V6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS37CA5D8V6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms