Protein–RNA interactions for Protein: A2A3L6

TTC24, Tetratricopeptide repeat protein 24, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC24A2A3L6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC24A2A3L6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC24A2A3L6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC24A2A3L6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms