Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQW1

LOC100506127, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC100506127A0A0U1RQW1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LOC100506127A0A0U1RQW1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LOC100506127A0A0U1RQW1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LOC100506127A0A0U1RQW1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms