Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 316.41■□□□□ 0.221e-44■□□□□ 8.8
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PUM1Q14671 SRRM2-204ENST00000570705 675 ntTSL 315.42■□□□□ 0.061e-44■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SRRM2-213ENST00000573311 732 ntTSL 215.39■□□□□ 0.051e-44■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SRRM2-211ENST00000572883 887 ntTSL 210.38□□□□□ -0.751e-44■□□□□ 8.8
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PUM1Q14671 PCBP2-226ENST00000562264 1145 ntTSL 511.01□□□□□ -0.651e-10■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.831e-10■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PCBP2-223ENST00000552819 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.91e-10■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.91e-10■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PCBP2-213ENST00000548933 1202 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.921e-10■□□□□ 8.8
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PUM1Q14671 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.245e-10■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 UBALD2-202ENST00000587913 286 ntTSL 311.67□□□□□ -0.545e-10■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 NASP-209ENST00000472408 541 ntTSL 210.04□□□□□ -0.85e-19■□□□□ 8.8
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PUM1Q14671 H3F3A-202ENST00000366814 1863 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.741e-8■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.077e-23■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.421e-8■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 RIOK3-209ENST00000584130 591 ntTSL 46.4□□□□□ -1.381e-8■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 MYB-207ENST00000430686 1036 ntTSL 55.72□□□□□ -1.491e-8■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.892e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.878e-14■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 APRT-203ENST00000562464 515 ntTSL 320.44■□□□□ 0.862e-7■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 ICAM5-203ENST00000586480 2599 ntTSL 1 (best)19.04■□□□□ 0.642e-7■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 APRT-207ENST00000567391 667 ntTSL 315.1■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 APRT-209ENST00000568319 542 ntTSL 313.43□□□□□ -0.262e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SMYD3-203ENST00000391836 732 ntTSL 513.22□□□□□ -0.292e-7■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 MLXIP-209ENST00000539861 1384 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.42e-7■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 KIAA0907-208ENST00000482337 1135 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 8.7
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PUM1Q14671 TOP3B-203ENST00000424393 824 ntTSL 511.32□□□□□ -0.62e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 KIAA0907-203ENST00000368321 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 KIAA0907-202ENST00000368320 4499 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.742e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SMYD3-212ENST00000483072 466 ntTSL 29.03□□□□□ -0.962e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SMYD3-202ENST00000366517 1372 ntTSL 1 (best)8.69□□□□□ -1.022e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SMYD3-201ENST00000366516 1863 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.032e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.062e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SMYD3-216ENST00000492487 634 ntTSL 38.07□□□□□ -1.122e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SMYD3-217ENST00000493441 823 ntTSL 28.04□□□□□ -1.122e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SMYD3-209ENST00000470510 1042 ntTSL 56.77□□□□□ -1.332e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 SMYD3-213ENST00000488153 653 ntTSL 35.85□□□□□ -1.472e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 BUB1-206ENST00000465029 1999 ntTSL 212.35□□□□□ -0.432e-17■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 BUB1-201ENST00000302759 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.882e-17■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.022e-17■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 BUB1-208ENST00000468927 714 ntTSL 58.07□□□□□ -1.122e-17■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 BUB1-207ENST00000466333 2501 ntTSL 1 (best)7.01□□□□□ -1.292e-17■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.342e-17■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 BUB1-209ENST00000477481 831 ntTSL 54.6□□□□□ -1.672e-17■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 CDK5RAP2-212ENST00000480112 5826 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.412e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.912e-7■□□□□ 8.7
PUM1Q14671 CDK5RAP2-209ENST00000473282 5956 ntTSL 1 (best)8.08□□□□□ -1.122e-7■□□□□ 8.7
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