RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-209ENST00000470356 NISCHQ9Y2I1 1504 aa77.91■■■■■ 10.06
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HMG20B-209ENST00000470356 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa59.34■■■■■ 7.09
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HMG20B-209ENST00000470356 PDS5BQ9NTI5 1447 aa59■■■■■ 7.04
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HMG20B-209ENST00000470356 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa58.89■■■■■ 7.02
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HMG20B-209ENST00000470356 CFTRP13569 1480 aa58.37■■■■■ 6.94
HMG20B-209ENST00000470356 CEP164Q9UPV0 1460 aa58.28■■■■■ 6.92
HMG20B-209ENST00000470356 WDR62O43379 1518 aa58.27■■■■■ 6.92
HMG20B-209ENST00000470356 FANCD2Q9BXW9 1451 aa58.26■■■■■ 6.92
HMG20B-209ENST00000470356 CCDC88BA6NC98 1476 aa57.95■■■■■ 6.87
HMG20B-209ENST00000470356 PRDM2Q13029 1718 aa57.81■■■■■ 6.85
HMG20B-209ENST00000470356 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP57.75■■■■■ 6.83
HMG20B-209ENST00000470356 TOPBP1Q92547 1522 aa57.21■■■■■ 6.75
HMG20B-209ENST00000470356 ABCC8Q09428 1581 aa57.16■■■■■ 6.74
HMG20B-209ENST00000470356 IFT140Q96RY7 1462 aa57.11■■■■■ 6.73
HMG20B-209ENST00000470356 DNMBPQ6XZF7 1577 aa57.03■■■■■ 6.72
HMG20B-209ENST00000470356 OSCARQ8IYS5 282 aa56.98■■■■■ 6.71
HMG20B-209ENST00000470356 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP56.96■■■■■ 6.71
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HMG20B-209ENST00000470356 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP56.64■■■■■ 6.66
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HMG20B-209ENST00000470356 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP56.62■■■■■ 6.65
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HMG20B-209ENST00000470356 FGD5Q6ZNL6 1462 aa56.34■■■■■ 6.61
HMG20B-209ENST00000470356 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP56.24■■■■■ 6.59
HMG20B-209ENST00000470356 CHD1O14646 1710 aa56.17■■■■■ 6.58
HMG20B-209ENST00000470356 WDR97A6NE52 1622 aa56.15■■■■■ 6.58
HMG20B-209ENST00000470356 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa56.12■■■■■ 6.57
HMG20B-209ENST00000470356 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa56.12■■■■■ 6.57
HMG20B-209ENST00000470356 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa56.12■■■■■ 6.57
HMG20B-209ENST00000470356 FBLN2P98095 1184 aa56.06■■■■■ 6.56
HMG20B-209ENST00000470356 ARHGEF11O15085 1522 aa56■■■■■ 6.56
HMG20B-209ENST00000470356 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa55.92■■■■■ 6.54
HMG20B-209ENST00000470356 GRIN2BQ13224 1484 aa55.88■■■■■ 6.54
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HMG20B-209ENST00000470356 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa55.76■■■■■ 6.52
HMG20B-209ENST00000470356 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP55.74■■■■■ 6.51
HMG20B-209ENST00000470356 GAPVD1Q14C86 1478 aa55.73■■■■■ 6.51
HMG20B-209ENST00000470356 PBRM1Q86U86 1689 aa55.65■■■■■ 6.5
HMG20B-209ENST00000470356 SYNJ2O15056 1496 aa55.64■■■■■ 6.5
HMG20B-209ENST00000470356 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP55.63■■■■■ 6.5
HMG20B-209ENST00000470356 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa55.61■■■■■ 6.49
HMG20B-209ENST00000470356 TOP2BQ02880 1626 aa55.59■■■■■ 6.49
HMG20B-209ENST00000470356 CYB5RLQ6IPT4 315 aa55.59■■■■■ 6.49
HMG20B-209ENST00000470356 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa55.58■■■■■ 6.49
HMG20B-209ENST00000470356 SYNJ1O43426 1573 aa55.56■■■■■ 6.48
HMG20B-209ENST00000470356 CLASP1Q7Z460 1538 aa55.55■■■■■ 6.48
HMG20B-209ENST00000470356 ARAP1Q96P48 1450 aa55.47■■■■■ 6.47
HMG20B-209ENST00000470356 GRIN2AQ12879 1464 aa55.15■■■■■ 6.42
HMG20B-209ENST00000470356 ADAMTS12P58397 1594 aa55.14■■■■■ 6.42
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HMG20B-209ENST00000470356 FHAD1B1AJZ9 1412 aa55.05■■■■■ 6.4
HMG20B-209ENST00000470356 NUP160Q12769 1436 aa54.96■■■■■ 6.39
HMG20B-209ENST00000470356 CEP170Q5SW79 1584 aa54.91■■■■■ 6.38
HMG20B-209ENST00000470356 TRHP20396 242 aaPredicted RBP54.82■■■■■ 6.37
HMG20B-209ENST00000470356 ERCC6L2Q5T890 1561 aa54.69■■■■■ 6.35
HMG20B-209ENST00000470356 SHROOM2Q13796 1616 aa54.67■■■■■ 6.34
HMG20B-209ENST00000470356 KIF27Q86VH2 1401 aa54.53■■■■■ 6.32
HMG20B-209ENST00000470356 IGF1RP08069 1367 aa54.48■■■■■ 6.31
HMG20B-209ENST00000470356 JPH4Q96JJ6 628 aa54.43■■■■■ 6.3
HMG20B-209ENST00000470356 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP54.39■■■■■ 6.3
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