Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP16Q9Y5T5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP16Q9Y5T5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
USP16Q9Y5T5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
USP16Q9Y5T5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP16Q9Y5T5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms